عمد قسم الوثائق في مركز تصوير المخطوطات وفهرستها إلى توثيق ما ترك لنا السيّد المجاهد من أرشيف عبر أحفاده الذين تسمّوا بأسرة (آل الحجّة).

وكان من أبرز شخصيّاتها هو (السيّد محمد باقر الحجّة الطباطبائيّ).

وقد قام المركز  بفرز كلّ ما يوجد من وثائق وإجازات شرعيّة ومراسلات فضلاً عن الأوراق والصور.

وعمل على ترقيمها معتمداً منهجيّة العنوان والموضوع والفحوى لكلّ وثيقة وما ورد فيها من قضايا وأمور مع ذكر تواريخ الوفيات للأعلام والشخصيّات المعروفة منهم.

بالإضافة إلى ذكر نوع الوثيقة مطبوعة كانت أم خطّيّة.