استُهلّت أعمال المؤتمر بتلاوة آياتٍ من الذكر الحكيم، أعقبتها كلمة سماحة السيد المتولي الشرعي، التي رحّب فيها بالوفود المشاركة، ولا سيّما القادمة من خارج العراق، مؤكّدًا أن علماء مدرسة أهل البيت (ع) خلّفوا إرثًا علميًّا كبيرًا لا يزال كثيرٌ منه بحاجة إلى الكشف والتحقيق. وأشار سماحته إلى المكانة المحورية للشيخ الطوسي في بغداد ثم في النجف، مبينًا أن هجرته إليها قبل نحو ألف عام شكّلت منعطفًا تاريخيًا اقترن به مسار الحوزة العلمية، حتى غدت آراؤه وتوجّهاته مؤثرة في الوسط العلمي إلى يومنا هذا، مثمّنًا الجهود التنظيمية والعلمية التي أسهمت في إقامة المؤتمر.
من جانبها، أكدت الهيأة العليا لإحياء التراث أن مشروع الألفية انطلق منذ سنوات عبر محاور متعدّدة شملت التأليف والتحقيق وإقامة الندوات والمؤتمرات، فضلًا عن تحقيق تراث الشيخ الطوسي والشروح المرتبطة به، بهدف إعادة قراءته قراءةً علمية معاصرة.
كما أُعلن عن صدور ثلاثة كتب تراثية محققة، إلى جانب إزاحة الستار عن إصدارين جديدين: «رسائل الفاضل الفشاركي» و«هداية الأنام في حكم أموال الإمام»، في إطار جهود إحياء التراث العلمي وترسيخ مكانة النجف بوصفها حاضرةً علميةً امتد عطاؤها لأكثر من ألف عام.
وشهدت الجلسة الافتتاحية في قاعة الإمام المرتضى (ع) عرضًا فيلميًا خاصًا بالمؤتمر، وإلقاء قصيدة شعرية للشيخ باقر الجدي، إلى جانب تقديم بحوث علمية متخصصة؛ إذ تناول البحث الأول المقارنة بين الأمالي الحديثية للصدوق والمفيد والطوسي، مع التركيز على «أمالي الشيخ الطوسي»، وخلص إلى ضرورة إعادة تحقيق الكتاب تحقيقًا علميًّا جديدًا. فيما ناقش البحث الثاني التحوّل المنهجي بين كتابي «الغيبة» للنعماني والشيخ الطوسي، مسلطًا الضوء على تطوّر الاستدلال العقدي بين المدرستين.
كما ألقى رئيس معهد البحوث الشيعية في جامعة تورنتو، الدكتور فيني خيتيا، كلمة أشاد فيها بجهود العتبة العباسية المقدسة في إحياء تراث شيخ الطائفة وتعزيز التعاون العلمي الدولي.
واختُتمت فعاليات اليوم الأول بتكريم الباحثين المشاركين تقديرًا لجهودهم العلمية، أعقبها تنظيم جولة اطلاعية في معرض صور المؤتمر، وسط أجواء علمية وثقافية عكست عمق الامتداد التاريخي لحوزة النجف الأشرف ودورها المتواصل في صناعة الوعي الديني والفكري عبر العصور.